关于婴幼儿患肛瘘的病因，目前尚不完全清楚，可能与下列因素有关：
①小儿骶骨曲尚未形成，两侧坐骨结节距离较近，加上肛门内括约肌紧张度较弱，因此粪便容易直接压迫肛管齿线处，肛窦粘膜易损伤、擦破，导致细菌入侵。
②小儿常因尿布皮炎，刺激肛周皮肤，致使毛囊、汗腺、皮脂腺感染，形成肛周皮下脓肿与肛窦相通而形成肛瘘。
③新生儿，尤其是男孩受母体激素失调的影响，使皮脂腺分泌亢进，易引起肛门皮脂腺炎，感染后成肛周脓肿与肛窦相通。
④新生儿免疫功能不全，如新生儿生理性缺乏免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白A(IgA)等，因此容易发生肛周感染，形成肛瘘。
据国内外统计，婴幼儿肛瘘在出生后6个月以内发病者占小儿肛瘘的2/3；在生后3个月内发病率最高，其中生后1个月内发病者为最多见。男性多于女性，男性占80%—95%，婴幼儿肛瘘发病部位多在肛门两侧，瘘管多呈浅在、单纯、垂直。复杂而瘘深的较少，有部分患儿未治可自愈，待成人后可再发。
根据肛门炎症、脓肿、瘘道三个不同阶段采用不同的治疗原则：
①当肛门周围尚未形成脓肿，仅见皮下有炎症反应时；可采用保守治疗，每日用温开水坐浴2—3次，适当吃些抗生素，局部可用金黄如意膏外敷等消炎、消肿治疗。
②如脓肿已形成，可切开排脓，预防反复感染，由于距肛窦较近，可一次切至肛窦，可避免日后成肛瘘。
③多数小儿肛瘘，可随发育生长自己愈合，所以一般不主张及时做根治手术，一旦肛瘘已形成，可等孩子稍大些，到5—10岁时再手术，可行瘘道切开术或挂线治疗。如在肛门两侧同时存在两个瘘道者，应分次行瘘道切开术，若采用挂线方法，可用胶线一次收紧即可。
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