无论良性肿瘤，还是恶性肿瘤，其表面粘膜感染或直接压迫肛门部，都可引起肛门疼痛。
根据解剖学的原理，齿线以上的神经来源于植物神经系统，对于疼痛的感受迟钝，因此内痔患者往往没有疼痛症状，而以便血和脱出为主要症状。齿线以下的神经属脊神经，对疼痛十分敏感，故外痔多以疼痛为主要症状。所以，有的痔疮患者肛门疼痛，而有的人却不疼痛，主要是由于不同部位的痔疮是由不同的神经支配所导致的。
①精神因素：多由精神紧张引起，如肛门直肠的神经官能症、阴部神经的症候群、坐骨神经痛以及尾骨神经痛反射至肛门而引起肛门疼痛。
②异物及不良饮食刺激：如外伤、直肠内异物、辛辣食物及酗酒等均可刺激肛门，而引起疼痛。
③肛门直肠周围感染：即肛门直肠周围脓肿、肛窦炎、肛乳头炎等，这些疾病也可造成肛门疼痛。
④肛门疾病：如痔疮嵌顿、炎性外痔、血栓外痔、肛裂、肛瘘等，均可引起肛门疼痛。
⑤肠道感染或腹泻、便秘：肠道感染，可使炎症刺激肛门，腹泻和便秘可使粪便通过肛门时，机械性刺激肛门，从而导致肛门疼痛。
⑥肛管直肠肿瘤
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