①清除内口：手术时要找到原发的内口，并把感染的肛窦、肛门腺及其导管切除干净，这是肛瘘治疗的关键。
②处理好瘘管及支管、死腔：要把瘘管的管道、支管、死腔等清除干净，以免术后复发。
③保留肛管直肠环：肛瘘手术时，应明确诊断，查明内口及瘘管走向，保留肛管直肠环，以维持正常的肛门括约功能。
总之，在具体手术操作中，一定要仔细寻找到内口，并防止切断肛管直肠环。预防上，注重肛门部卫生，养成每日排便的习惯，及时正确处理肛周感染和脓肿，是预防肛瘘的重要措施。
肛瘘怎么治疗一般如瘘管引流通常，局部症状不显着，只需在便后用温水清洗，保持干燥，如外口封闭，局部红肿胀痛，可用抗生素，或切开排脓。挂线疗法，祖国医学治疗肛瘘的方法，通过线的结扎，使组织绞窄坏死而逐渐切开瘘管，挂线的过程是边切开边愈合的过程，预后较好。肛瘘手术，通过外科手术治疗肛瘘。
肛瘘有两个口，内口和外口，临床表现有反复的自外口流出小量的脓液，刺激肛周皮肤，有搔痒感，有时因外口暂时封闭，使脓液积存，局部呈红肿胀疼，封闭的外口可以再次穿破，或在四周穿破形成另一个外口，如此反复发作，可造成多个外口，相互通连，长久不愈。
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