中医内治法一般应用于初起内痔、外痔或年老体弱病人，中后期内外痔兼有其它严重疾病的病人(如肝病、肾病、腹部肿瘤等)，或肛裂、肛管直肠周围脓肿、瘘管发炎期以及一切肛门感染初起者。
肛瘘治疗方法，可以归纳为消、托、补三大法则，临床上应根据病情不同而灵活运用。如在治疗肛门直肠痈疽中，可根据其发病过程中的初起、成脓、溃后三个阶段，分别以消、托、补三法治疗，这是运用这一治疗总则的典型。
1. 消法：
这是用消散的yao物，使初起的肛周痈疽和炎性外痔等得到消散，免受溃脓和切开之苦。此法适用于没有成脓的肛周痈疽、炎性外痔、血栓外痔和肛裂等病。但具体用法是极其灵活的，因为各种疾病的病因不同，病的性质也各不相同，所以，治疗方法也必须因病而异。如有表邪者宜解表，里实者宜通里，热毒蕴结者应清热解毒，寒邪凝结者应温通，气滞者要行气，血瘀者要活血化瘀等。同时，还需根据病人体质的强弱，痈疽所属的不同经络，灵活施治。凡未成脓者，可以内消，即使不能内消，也可移深出浅，转重为轻;如脓已成，则不可用内消之法，以免养脓为患，毒散不收，血气受损，脓毒内蕴，反会侵蚀好肉，溃烂后难于收敛。
2. 托法：
这是用补益气血的yao物，扶助正气，托毒外泄，以免毒邪内陷。此法适用于肛周脓肿中期，正气虚弱，毒邪偏盛，不能托毒外透，肛周痈疽外形平塌，根脚散漫，难溃难腐的虚证。如毒气盛而正气未衰者，可用透脓的yao物，促其早日泄出脓毒，肿消痛减，以免脓毒旁窜，造成后患。
3. 补法：
这是用补益的yao物，恢复正气，助养患处新生，使疮口、瘘口早日愈合。此法适用于老年体虚，气血虚弱，溃疡后期，或肛肠疾病术后，热毒已去，病灶巳除，而精神衰疲，元气虚弱，脓水清稀，疮口难敛者，以及便血和脱垂等病人。凡气血虚弱者，宜补养气血，凡脾胃虚弱者，宜理脾和胃，凡肝肾不足者，宜补养肝肾等。但在毒邪未尽的时候，切勿早用补法，以免病邪内蕴，久而为患。
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