便秘根据有无明确病因分为功能性便秘和器质性便秘两大类。
器质性便秘往往由肠道内外的器质性疾病引起，包括肠道内的肿瘤、炎症、先天性手术疤痕以及肠道外的糖尿病、甲亢腺功能低下和神经系统疾病等。虽然这类便秘占少数，但因为某些疾病如肿瘤引起的便秘可能致命，所以医生提醒要更为重视。
是否器质性便秘，可以根据一些“报警症状”判断：年龄大，最近几个月才出现，便秘伴有血便或黑便，提示有消化道出血现象。伴消瘦、贫血、发烧或实验室辅助检查结果有异常。如果有以上症状出现，还需要到医院进行全面检查，确诊后宜尽快医治原有的疾病。
慢性便秘也需慎重对待。在过去一年里，有3个月出现大便次数减少（每周少于3次）、大便性状改变，很硬或伴有明显的排便困难、排便费力，就是慢性便秘。患慢性便秘的病人除了感觉十分痛苦，其结肠ai及老年性痴呆的发病率也较普通人高。有肝病的人如患慢性便秘还易引起肝性脑病；有急性心肌梗塞、急性脑出血的人患便秘会加重病情。
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