在婴幼儿当中，内痔十分罕见，外痔在小儿偶而有发生的，常见的婴幼儿肛肠疾病有以下几种：
肛门瘙痒
小儿肛门瘙痒的一个常见疾病是蛲虫病。蛲虫寄生在肠道，雌虫往往在夜间爬出肛门外排卵，虫卵污染手指、衣被然后直接或经过扬起的灰尘进入消化道，再发育成成虫，因此发生自身的重复感染或感染他人。肛门瘙痒往往发生在夜间，影响睡眠。家长可在小儿入睡2—3小时后，检查肛门周围皮肤皱褶处，可发现白色线头样的成虫。
肛裂
多因粪便干结引起，常发生在肛管后方正中，用双手稍加分开一下肛门，可以看到这一裂隙，肛裂时出血量少色鲜红，附在粪便表面或在手纸上可见；排便时剧烈的疼痛，小儿因而哭闹、不愿排大便，又使患儿大便更加干燥，致肛裂长久不愈。
脱肛
婴幼儿的直肠与肛管上下处在一条直线上，其周围组织比较松驰，肌肉比较薄弱（尤其是营养不良或有消化性疾病患儿），在2岁前后开始坐便盆排便，此时会阴底部所受腹压要大，大便也硬一些，如有便秘需使劲屏气，延长坐盆时间，或频繁腹泻，或有咳嗽、包茎、尿道膀胱结石等增加腹压的情况，均容易引起脱肛。脱肛初始仅在用劲排便时出现，便后可以自动缩回，后来可能要用手帮助送回去，不大便时(如哭闹)也可出现。如长时间不将它送回，可发生水肿、渗血、溃疡而引起坠胀、疼痛、里急后重，流脓血粘液。绝大多数脱肛的患儿可在5岁之前自愈。
肛门周围脓肿
小儿，尤其是新生儿、婴幼儿皮肤娇嫩，容易因大小便浸渍、粗硬不洁尿布的摩擦、粗糙手纸的损伤等，致化脓性细菌侵入引起。全身也可发热，小儿可有哭闹、拒食、呕吐现象。如未治疗可化脓破溃流脓形成肛瘘。
直肠息肉
小儿便血的最常见原因是直肠息肉，它也是小儿肛肠外科最常见的疾病，可占约30%。其形成原因可能与遗传因素、炎症、机械性慢性刺激(便秘、粗糙的粪便)、病毒等有关。息肉的形状一般犹如一粒带蒂的小葡萄，颜色由淡红、深红到紫红均有，表面可像桑椹或杨梅的刺状，数目可单个或多个，距离肛门口可远可近，有时可因排便而被带出到肛门外。这种息肉引起的便血一般色较鲜红，附着在大便表面而不互相混和，少见单纯血便而无粪质者。细心观察可在粪便上看到沟槽状压迹，为粪便通过息肉时所造成。小儿一般无腹痛、里急后重等。长期少量出血可以引起小儿贫血，息肉还可能引起肠蠕动紊乱诱发肠套叠。
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