一、局部的并发症 见于约1／4的病例中。
(一)急性结肠扩张与溃疡穿孔 见于急性暴发，多累及横结肠或全部结肠，受累结肠大量充气致腹部膨隆，肠鸣减弱或消失。在结肠扩张基础上易引起溃疡穿孔并发急性弥漫性腹膜炎。
(二)结肠和肛周疾病 有肛裂，肛瘘、直肠脱垂；结肠、直肠、肛门周围及坐骨直肠窝等脓肿；直肠—阴道、直肠—膀胱，肛门—直肠、结肠—小肠等瘘管形成。
(三)结肠大量出血。
(四)结肠假息肉形成，少数可发生ai变。上海报告的117例中，直肠息肉占9.4％、ai变占0.8％，ai变率远较国外为低。ai变的发生与疾病时限和病变范围有关。病程越长、范围越广、ai变越多。
(五)结肠狭窄和肠梗阻 修复过程中的大量纤维组织形成的瘢痕可引起结肠狭窄和肠梗阻，多见于结肠远端。
(六)痔疮。
二、全身的并发症 不多见(＜10％)，由于毒素、肠吸收不良，衰弱等所致，有些可能与自身免疫有关。
(一)皮肤、粘膜表现 可有结节性红斑、多型红斑、口疮性溃疡、坏疽性脓皮病等。
(二)眼损害 可有结膜炎、虹膜炎、眼色素层炎等。
(三)一过性游走性关节痛 偶尔有强直性脊椎炎。
(四)肝病 可有脂肪肝、慢性活动性肝炎、坏死后性肝硬化、胆管周围炎、硬化性胆管炎等。
(五)血液学的表现 贫血可由缺铁、自身免疫性溶血、微血管病性溶血以及柳氮磺胺吡啶治疗后所致的赫恩小体溶血性贫血等因素引起。此外，可有血栓性栓塞现象，由于血小板增多和凝血异常所致。
(六)肾脏病变 肾盂肾炎和肾石病在本病中发病数高。
(七)儿童患者可影响生长和发育。
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